Ọgbọ nke mbinye aka dabere na LncRNA metụtara ọrịa mgbochi iji mata ndị ọrịa pancreatic Adenocarcinoma dị elu na nke dị obere |BMC Gastroenterology

Ọrịa cancer pancreatic bụ otu n'ime etuto ahụ kacha egbu egbu n'ụwa nke nwere amụma na-adịghị mma.Ya mere, a chọrọ ihe atụ amụma ziri ezi iji chọpụta ndị ọrịa nwere nnukwu ihe ize ndụ nke ọrịa cancer pancreatic iji kwado ọgwụgwọ ma melite prognosis nke ndị ọrịa a.
Anyị nwetara Ọrịa Cancer Genome Atlas (TCGA) pancreatic adenocarcinoma (PAAD) RNAseq data sitere na nchekwa data UCSC Xena, chọpụtara lncRNAs (irlncRNAs) metụtara mgbochi site na nyocha mmekọrịta, wee chọpụta ọdịiche dị n'etiti TCGA na anụ ahụ adenocarcinoma pancreatic nkịtị.DEirlncRNA) sitere na TCGA na okwu anụ ahụ genotype (GTEx) nke anụ ahụ pancreatic.A na-eme nyocha ọzọ nke otu na lasso regression iji wuo ụdị mbinye aka prognostic.Anyị wee gbakọọ mpaghara dị n'okpuru usoro ahụ wee chọpụta uru mbelata kacha mma maka ịchọpụta ndị ọrịa nwere adenocarcinoma pancreatic dị elu na nke dị obere.Iji tụnyere njirimara ụlọ ọgwụ, ntinye cell nke na-alụso ọrịa ọgụ, microenvironment immunosuppressive, na nguzogide chemotherapy na ndị ọrịa nwere ọrịa kansa pancreatic dị elu na nke dị ala.
Anyị chọpụtara ụzọ abụọ DEirlncRNA 20 wee chịkọta ndị ọrịa dịka uru mbelata kacha mma si dị.Anyị gosipụtara na ụdị mbinye aka prognostic anyị nwere arụmọrụ dị ukwuu n'ịkọ amụma amụma nke ndị ọrịa nwere PAAD.AUC nke usoro ROC bụ 0.905 maka amụma afọ 1, 0.942 maka amụma afọ 2, yana 0.966 maka amụma afọ 3.Ndị ọrịa nwere nnukwu ihe ize ndụ nwere ọnụ ọgụgụ nlanarị dị ala yana njirimara ụlọ ọgwụ ka njọ.Anyị gosikwara na ndị ọrịa nwere nnukwu ihe ize ndụ bụ ndị a na-egbochi immunosuppressed ma nwee ike ịmalite iguzogide immunotherapy.Nyochaa ọgwụ mgbochi ọrịa cancer dị ka paclitaxel, sorafenib, na erlotinib dabere na ngwaọrụ amụma mgbakọ na mwepụ nwere ike bụrụ ihe kwesịrị ekwesị maka ndị ọrịa nwere nnukwu ihe ize ndụ na PAAD.
N'ozuzu, ọmụmụ ihe anyị hibere usoro ihe ize ndụ ọhụụ nke dabere na ejikọta ọnụ irlncRNA, nke gosipụtara uru prognostic na-ekwe nkwa na ndị ọrịa nwere ọrịa kansa pancreatic.Ụdị ihe ize ndụ nke prognostic anyị nwere ike inyere ndị ọrịa nwere PAAD aka dị iche iche maka ọgwụgwọ ahụike.
Ọrịa cancer pancreatic bụ akpụ na-adịghị mma nke nwere obere ndụ ndụ afọ ise na ọkwa dị elu.N'oge nchoputa, ọtụtụ ndị ọrịa abanyelarị n'ọkwa dị elu.N'ihe gbasara ọrịa COVID-19, ndị dọkịta na ndị nọọsụ nọ n'oké nrụgide mgbe ha na-agwọ ndị ọrịa nwere ọrịa kansa pancreatic, ezinụlọ ndị ọrịa na-enwekwa ọtụtụ nrụgide mgbe ha na-eme mkpebi ọgwụgwọ [1, 2].Ọ bụ ezie na e nweela ọganihu dị ukwuu n'ịgwọ DOAD, dị ka ọgwụgwọ neoadjuvant, resection ịwa ahụ, ọgwụgwọ radieshon, chemotherapy, ezubere iche maka ọgwụgwọ molecular, na ndị na-enyocha ihe mgbochi (ICIs), naanị ihe dị ka 9% nke ndị ọrịa na-adị ndụ afọ ise mgbe nyochachara [3] ].], 4].N'ihi na mgbaàmà mbụ nke adenocarcinoma pancreatic bụ ihe a na-ahụkarị, a na-achọpụtakarị ndị ọrịa nwere metastases na ọkwa dị elu [5].Ya mere, maka onye ọrịa nyere, ọgwụgwọ zuru oke n'otu n'otu ga-atụle uru na ọghọm dị na nhọrọ ọgwụgwọ niile, ọ bụghị nanị iji mee ka ndụ dịkwuo ogologo, kamakwa iji melite ogo ndụ [6].Ya mere, ihe atụ amụma dị irè dị mkpa iji nyochaa nke ọma prognosis nke onye ọrịa [7].Ya mere, enwere ike ịhọrọ ọgwụgwọ kwesịrị ekwesị iji dozie ndụ na ndụ ndụ nke ndị ọrịa nwere PAAD.
Amụma adịghị mma nke PAAD bụ n'ihi iguzogide ọgwụ chemotherapy.N'afọ ndị na-adịbeghị anya, a na-eji ndị na-egbochi ihe mgbochi mgbochi ọrịa na-agwọ ọrịa etuto siri ike [8].Otú ọ dị, iji ICI na ọrịa cancer pancreatic adịghị adịkarị nke ọma [9].Ya mere, ọ dị mkpa ịmata ndị ọrịa nwere ike irite uru na ọgwụgwọ ICI.
Ogologo RNA na-abụghị koodu (lncRNA) bụ ụdị RNA na-enweghị koodu nwere transcript> 200 nucleotides.LncRNA juru ebe niile ma bụrụ ihe dịka 80% nke transcriptome mmadụ [10].Otu nnukwu ọrụ egosila na ụdị prognostic dabere na lncRNA nwere ike buru amụma amụma onye ọrịa nke ọma [11, 12].Ọmụmaatụ, 18 autophagy metụtara lncRNA ka achọpụtara iji mepụta mbinye aka prognostic na ọrịa kansa ara [13].Ejiri lncRNA isii ndị ọzọ metụtara mgbochi iji guzobe njirimara prognostic nke glioma [14].
Na ọrịa kansa pancreatic, ụfọdụ ọmụmụ ewepụtala mbinye aka dabere na lncRNA iji buo amụma amụma onye ọrịa.Emebere mbinye aka 3-lncRNA na pancreatic adenocarcinoma nwere mpaghara n'okpuru ROC curve (AUC) nke naanị 0.742 yana nlanarị (OS) nke afọ 3 [15].Na mgbakwunye, ụkpụrụ okwu lncRNA dị iche iche n'etiti genomes dị iche iche, ụdị data dị iche iche, na ndị ọrịa dị iche iche, na arụmọrụ nke ihe atụ amụma anaghị akwụsi ike.Ya mere, anyị na-eji algọridim nlegharị anya akwụkwọ akụkọ, njikọta na iteration, iji wepụta mbinye aka lncRNA (irlncRNA) metụtara mgbochi iji mepụta ụdị amụma ziri ezi ma kwụsie ike [8].
A na-enweta data RNAseq nkịtị (FPKM) na ọrịa cancer pancreatic TCGA na genotype anụ ahụ (GTEx) data sitere na nchekwa data UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/).E nwetara faịlụ GTF site na nchekwa data Ensembl (http://asia.ensembl.org) wee wepụta profaịlụ okwu lncRNA na RNAseq.Anyị si na nchekwa data ImmPort (http://www.immport.org) budata mkpụrụ ndụ ihe nketa mgbochi ma chọpụta lncRNA (irlncRNAs) metụtara mgbochi site na iji nyocha mmekọrịta (p <0.001, r> 0.4).Nchọpụta nke irlncRNA dị iche iche (DEirlncRNA) egosipụtara site na ịgafe irlncRNA na egosipụtara n'ụzọ dị iche iche lncRNA nwetara site na nchekwa data GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) na TCGA-PAAD otu (|logFC|> 1 na FDR). ) <0.05).
A kọwala usoro a na mbụ [8].Kpọmkwem, anyị na-ewu X iji dochie anya lncRNA A na lncRNA B. Mgbe ọnụ ahịa okwu nke lncRNA A dị elu karịa ọnụ ahịa okwu nke lncRNA B, a na-akọwa X dị ka 1, ma ọ bụghị X na-akọwa dịka 0. Ya mere, anyị nwere ike nweta. matriks nke 0 ma ọ bụ - 1. Axis vetikal nke matriks na-anọchi anya nlele ọ bụla, na axis kwụ ọtọ na-anọchi anya ụzọ DEirlncRNA ọ bụla nwere uru 0 ma ọ bụ 1.
A na-eji nyocha nlọghachi azụ na-enweghị atụ nke Lasso regression sochiri iji nyochaa ụzọ abụọ DEirlncRNA prognostic.Nyocha nke lasso regression jiri 10-fold cross-validation ugboro ugboro 1000 (p <0.05), na 1000 random stimuli kwa ọsọ.Mgbe ugboro nke otu DEirlncRNA ọ bụla gafere 100 ugboro na okirikiri 1000, ahọpụtara ụzọ abụọ DEirlncRNA iji wuo ụdị ihe egwu dị egwu.Anyị wee jiri usoro AUC chọta uru mbelata kacha mma maka ikewa ndị ọrịa PAAD n'ime otu dị elu na obere ihe egwu.A gbakọọkwa uru AUC nke ụdị ọ bụla ma chepụta ya dị ka mgbanaka.Ọ bụrụ na usoro ahụ ruru ebe kachasị elu na-egosi uru AUC kachasị elu, usoro ngụkọ na-akwụsị ma a na-ewere ihe nlereanya ahụ dị ka onye nyocha kacha mma.1-, 3- na 5 afọ ROC curve ụdị e wuru.A na-eji nyocha mgbanwe dị iche iche na nke dị iche iche iji nyochaa arụmọrụ amụma nke onwe nke ụdị ihe ize ndụ prognostic.
Jiri ngwaọrụ asaa mụọ ọnụego nnabata nke cell nke na-alụso ọrịa ọgụ, gụnyere XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, na CIBERSORT.Ebutere data ntinye n'ime mkpụrụ ndụ ihe mgbochi na nchekwa data TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).A na-enyocha ihe dị iche na ọdịnaya nke mkpụrụ ndụ na-alụso ọrịa ọgụ n'etiti ìgwè dị elu na nke dị ala nke ihe nlereanya ahụ e wuru site na iji ule Wilcoxon bịanyere aka na ya, a na-egosipụta nsonaazụ ya na eserese square.Emere nyocha mmekọrịta Spearman iji nyochaa mmekọrịta dị n'etiti ụkpụrụ akara ihe ize ndụ na sel ndị na-abanye n'ime ahụ.A na-egosi ọnụọgụ mmekọrịta dị ka lollipop.Edebere ọnụ ụzọ dị mkpa na p <0.05.Emere usoro a site na iji ngwugwu R ggplot2.Iji nyochaa njikọ dị n'etiti ụdị na ọkwa mkpụrụ ndụ ihe nketa jikọtara ọnụ ọgụgụ ntinye nke cell na-alụso ọrịa ọgụ, anyị mere ngwugwu ggstatsplot na nhụta atụmatụ violin.
Iji nyochaa usoro ọgwụgwọ ụlọ ọgwụ maka ọrịa kansa pancreatic, anyị gbakọrọ IC50 nke ọgwụ chemotherapy a na-ejikarị na otu TCGA-PAAD.A na-atụnyere ọdịiche dị na ọkara ihe mgbochi mgbochi (IC50) n'etiti ìgwè dị elu na nke dị ala site na iji ule Wilcoxon bịanyere aka na ya, na-egosikwa nsonaazụ ya dị ka igbe igbe na-emepụta site na iji pRrophetic na ggplot2 na R. Usoro niile na-agbaso ụkpụrụ nduzi na ụkpụrụ dị mkpa.
E gosipụtara usoro ọmụmụ nke ọmụmụ anyị na eserese 1. N'iji nyocha mmekọrịta dị n'etiti lncRNA na mkpụrụ ndụ ihe nketa metụtara ọrịa, anyị họrọ 724 irlncRNA na p <0.01 na r> 0.4.Anyị mechara nyochaa lncRNA ndị akọwapụtara dị iche iche nke GEPIA2 (Foto 2A).Ngụkọta nke 223 irlncRNA ka egosipụtara iche n'etiti adenocarcinoma pancreatic na anụ ahụ pancreatic nkịtị (|logFC|> 1, FDR <0.05), aha ya bụ DEirlncRNAs.
Ewu nke amụma ize ndụ ụdị.(A) Atụmatụ mgbawa ugwu nke lncRNA egosipụtara iche.(B) Nkesa ọnụọgụ lasso maka ụzọ abụọ DEirlncRNA 20.(C) Ọdịiche enwere ike nke nkesa ọnụọgụ LASSO.(D) nkata ọhịa na-egosi nyocha nlọghachi azụ nke ụzọ abụọ DEirlncRNA 20.
Anyị mechara wuo matrix 0 ma ọ bụ 1 site na ijikọ 223 DEirlncRNA.Achọpụtara ngụkọta nke ụzọ abụọ 13,687 DEirlncRNA.Mgbe nyocha nke univariate na lasso regression, 20 DEirlncRNA abụọ mechara nwale iji wuo ụdị ihe egwu prognostic (Ọnyonyo 2B-D).Dabere na nsonaazụ Lasso na nyochaghachi ọtụtụ nyocha, anyị gbakọrọ akara ihe ize ndụ maka onye ọrịa ọ bụla nọ na ngalaba TCGA-PAAD (Table 1).Dabere na nsonaazụ nyocha regression lasso, anyị gbakọrọ akara ihe ize ndụ maka onye ọrịa ọ bụla nọ na ngalaba TCGA-PAAD.AUC nke ROC curve bụ 0.905 maka amụma amụma ihe egwu afọ 1, 0.942 maka amụma afọ 2, yana 0.966 maka amụma afọ 3 (Nyocha 3A-B).Anyị debere ọnụ ahịa mbelata kacha mma nke 3.105, mebere ndị ọrịa TCGA-PAAD n'ime otu dị oke egwu na nke dị ala, wee kpaapụta nsonaazụ nlanarị na nkesa akara ihe egwu maka onye ọrịa ọ bụla (Nyocha 3C-E).Nnyocha nke Kaplan-Meier gosiri na nlanarị nke ndị ọrịa PAAD n'ime ndị nwere nnukwu ihe ize ndụ dị ala karịa nke ndị ọrịa nọ na obere ihe ize ndụ (p <0.001) (Nyocha 3F).
Ịdị irè nke ụdị ihe egwu prognostic.(A) ROC nke ụdị ihe egwu prognostic.(B) 1-, 2-, na 3 afọ ROC ụdị ihe ize ndụ prognostic.(C) ROC nke ụdị ihe egwu prognostic.Na-egosi ebe nkwụsị kacha mma.(DE) Nkesa ọkwa nlanarị (D) yana akara ihe egwu (E).(F) Kaplan-Meier nyocha nke ndị ọrịa PAAD na otu dị elu na obere ihe ize ndụ.
Anyị gara n'ihu nyochaa ọdịiche dị na ọnụọgụ ihe ize ndụ site na njirimara ụlọ ọgwụ.Mpempe mpempe akwụkwọ (Ọnyonyo 4A) na-egosi njikọ zuru oke n'etiti njirimara ụlọ ọgwụ na akara ihe egwu.Karịsịa, ndị ọrịa meworo agadi nwere ọnụ ọgụgụ dị elu nke ihe ize ndụ (Foto 4B).Tụkwasị na nke ahụ, ndị ọrịa nwere ọkwa II nwere ọnụọgụ dị elu karịa ndị ọrịa nwere ọkwa I (Figure 4C).Banyere ọkwa akpụ na ndị ọrịa PAAD, ndị ọrịa 3 ọkwa nwere ọnụọgụ dị elu karịa ndị ọrịa 1 na 2 (Nyocha 4D).Anyị gara n'ihu na-eme nyocha nyocha nke univariate na multivariate ma gosipụta na akara ihe ize ndụ (p <0.001) na afọ (p = 0.045) bụ ihe ndị nwere onwe ha na-ahụ maka ndị ọrịa nwere PAAD (Nyocha 5A-B).Usoro ROC gosipụtara na akara ihe ize ndụ dị elu karịa njirimara ụlọ ọgwụ ndị ọzọ n'ịkọ amụma ndụ 1-, 2- na 3 afọ nke ndị ọrịa nwere PAAD (Nyocha 5C-E).
Njirimara ụlọ ọgwụ nke ụdị ihe egwu prognostic.Histogram (A) na-egosi (B) afọ, (C) ọkwa tumor, (D) ọkwa etuto, akara ihe ize ndụ, na okike nke ndị ọrịa nọ na otu TCGA-PAAD.** p <0.01
Nyocha amụma nke onwe nke ụdị ihe egwu prognostic.(AB) Univariate (A) na multivariate (B) nyocha regression nke ụdị ihe ize ndụ prognostic na njirimara ụlọ ọgwụ.(CE) 1-, 2-, na 3 afọ ROC maka ụdị ihe egwu prognostic na njirimara ụlọ ọgwụ.
Ya mere, anyị nyochara mmekọrịta dị n'etiti oge na akara ihe ize ndụ.Anyị chọpụtara na akara ihe ize ndụ na ndị ọrịa PAAD jikọtara ya na sel CD8 + T na sel NK (Njirimara 6A), na-egosi ọrụ mgbochi mgbochi na otu ndị nwere nnukwu ihe egwu.Anyị tụlekwara ihe dị iche na ntinye nke cell na-alụso ọrịa ọgụ n'etiti otu dị elu na nke dị ala ma chọta otu nsonaazụ ahụ (Nyocha 7).Enwere obere ntinye nke sel CD8+ T na sel NK n'ime otu nwere nnukwu ihe egwu.N'afọ ndị na-adịbeghị anya, a na-eji ndị na-eme ihe mgbochi mgbochi mgbochi (ICIs) eme ihe n'ọtụtụ ebe n'ịgwọ etuto siri ike.Agbanyeghị, iji ICI na ọrịa kansa pancreatic enwebeghị ihe ịga nke ọma.Ya mere, anyị tụlere okwu nke mkpụrụ ndụ ihe nketa mgbochi mgbochi na otu dị elu na obere ihe ize ndụ.Anyị chọpụtara na CTLA-4 na CD161 (KLRB1) na-ejupụta n'ime otu obere ihe ize ndụ (Nyocha 6B-G), na-egosi na ndị ọrịa PAAD nọ n'ime obere ihe ize ndụ nwere ike ịmasị ICI.
Ntụle njikọ nke ụdị ihe egwu prognostic na ntinye sel mgbochi.(A) Mmekọrịta dị n'etiti ụdị ihe egwu prognostic na ntinye cell nke na-alụso ọrịa ọgụ.(BG) Na-egosi okwu mkpụrụ ndụ ihe nketa na otu dị elu na nke dị ala.(HK) ụkpụrụ IC50 maka ọgwụ mgbochi ọrịa kansa na otu dị elu na nke dị ala.*p <0.05, **p <0.01, ns = abaghị uru
Anyị gara n'ihu nyochaa njikọ dị n'etiti ọnụọgụ ihe ize ndụ na ndị na-ahụ maka ọgwụgwọ chemotherapy na otu TCGA-PAAD.Anyị na-achọ ọgwụ anticancer nke a na-ejikarị na ọrịa kansa pancreatic wee nyochaa ọdịiche dị na ụkpụrụ IC50 ha n'etiti otu dị elu na nke dị obere.Nsonaazụ gosiri na uru IC50 nke AZD.2281 (olaparib) dị elu n'ime ìgwè ndị nwere nsogbu dị elu, na-egosi na ndị ọrịa PAAD nọ n'òtù dị ize ndụ nwere ike iguzogide ọgwụgwọ AZD.2281 (Figure 6H).Tụkwasị na nke ahụ, ụkpụrụ IC50 nke paclitaxel, sorafenib, na erlotinib dị ala n'ime ìgwè dị ize ndụ (Figure 6I-K).Anyị gara n'ihu chọpụta ọgwụ 34 anticancer nwere ụkpụrụ IC50 dị elu n'ime otu ndị nwere nnukwu ihe ize ndụ yana ọgwụ 34 anticancer nwere ụkpụrụ IC50 dị ala na otu nnukwu ihe ize ndụ (Table 2).
Enweghị ike ịgọnarị na lncRNA, mRNA, na miRNA dị ebe niile ma na-ekere òkè dị mkpa na mmepe ọrịa kansa.Enwere ezigbo ihe akaebe na-akwado ọrụ dị mkpa nke mRNA ma ọ bụ miRNA n'ịkọ amụma nlanarị n'ọtụtụ ụdị ọrịa kansa.Obi abụọ adịghị ya, ọtụtụ ụdị ihe egwu prognostic dabere na lncRNA.Dịka ọmụmaatụ, Luo et al.Nnyocha egosiwo na LINC01094 na-arụ ọrụ dị mkpa na mgbasa PC na metastasis, na nkwupụta dị elu nke LINC01094 na-egosi ndụ na-adịghị mma nke ndị ọrịa cancer pancreatic [16].Ọmụmụ ihe nke Lin et al.Nnyocha egosiwo na mbelata nke lncRNA FLVCR1-AS1 jikọtara ya na prognosis na-adịghị mma na ndị ọrịa cancer pancreatic [17].Agbanyeghị, lncRNA ndị metụtara ihe mgbochi ka a na-atụle obere okwu n'ihe gbasara ịkọ nlanarị nke ndị ọrịa kansa.N'oge na-adịbeghị anya, a na-elekwasị anya na-arụ ọrụ dị ukwuu n'ịwupụta ụdị ihe ize ndụ prognostic iji buru amụma banyere nlanarị nke ndị ọrịa cancer ma si otú ahụ gbanwee usoro ọgwụgwọ [18, 19, 20].A na-amata na-eto eto maka ọrụ dị mkpa nke ndị na-alụso ọrịa ọgụ na-abanye na mmalite ọrịa kansa, ọganihu, na nzaghachi na ọgwụgwọ dị ka chemotherapy.Ọtụtụ nchọpụta ekwenyela na mkpụrụ ndụ na-egbochi ọrịa tumor na-arụ ọrụ dị oke mkpa na nzaghachi nke chemotherapy cytotoxic [21, 22, 23].Microenvironment na-alụso ọrịa ọgụ tumor bụ ihe dị mkpa na ndụ nke ndị ọrịa tumo [24, 25].Immunotherapy, karịsịa ọgwụgwọ ICI, na-ejikarị na-agwọ ọrịa etuto siri ike [26].A na-eji mkpụrụ ndụ ihe nketa metụtara na-alụ ọgụ iji wuo ụdị ihe egwu dị egwu.Dịka ọmụmaatụ, Su et al.Ụdị ihe ize ndụ prognostic metụtara mgbochi na-adabere na mkpụrụ ndụ ihe nketa protein iji buru amụma amụma nke ndị ọrịa cancer ovarian [27].Mkpụrụ ndụ ihe nketa na-abụghị koodu dị ka lncRNA dịkwa mma maka ịmepụta ụdị ihe egwu dị egwu [28, 29, 30].Luo et al nwalere lncRNA anọ metụtara mgbochi wee wuo ihe atụ amụma maka ihe egwu cancer cervical [31].Khan et al.Achọpụtara mkpokọta 32 dị iche iche dị iche iche, ma dabere na nke a, e guzobere ihe atụ amụma nke nwere ihe odide 5 dị ịrịba ama, bụ nke a tụrụ aro ka ọ bụrụ ngwá ọrụ akwadoro nke ukwuu maka ịkọ biopsy-gosipụtara nnukwu jụrụ oyi mgbe a na-atụgharị akụrụ [32].
Ọtụtụ n'ime ụdị ndị a dabere n'ọkwa ngosipụta mkpụrụ ndụ ihe nketa, ma ọ bụ mkpụrụ ndụ ihe nketa protein ma ọ bụ mkpụrụ ndụ ihe na-abụghị koodu.Agbanyeghị, otu mkpụrụ ndụ ihe nketa nwere ike ịnwe ụkpụrụ ngosipụta dị iche iche na genomes dị iche iche, usoro data na n'ụdị ndị ọrịa dị iche iche, na-eduga na atụmatụ enweghị ntụkwasị obi na ụdị amụma.N'ime ọmụmụ ihe a, anyị jiri ụzọ abụọ nke lncRNA rụpụtara ihe atụ nwere ezi uche, na-adabereghị na ụkpụrụ ngosipụta ziri ezi.
N'ime ọmụmụ ihe a, anyị chọpụtara irlncRNA na nke mbụ site na nyocha mmekọrịta yana mkpụrụ ndụ ihe nketa metụtara mgbochi.Anyị nyochara 223 DEirlncRNA site na ngwakọ nwere lncRNA ndị akọwapụtara iche.Nke abụọ, anyị rụrụ matriks 0-ma ọ bụ-1 dabere na usoro njikọ DEirlncRNA ebipụtara [31].Anyị mechara nyocha univariate na lasso regression iji chọpụta ụzọ abụọ DEirlncRNA prognostic ma wuo ụdị ihe egwu amụma.Anyị gara n'ihu nyochaa njikọ dị n'etiti ọnụọgụ ihe ize ndụ na njirimara ụlọ ọgwụ na ndị ọrịa nwere PAAD.Anyị chọpụtara na ụdị ihe ize ndụ nke prognostic anyị, dị ka ihe na-ahụ maka onwe ya na ndị ọrịa PAAD, nwere ike ịmata ọdịiche dị n'etiti ndị ọrịa dị elu site na ndị ọrịa dị ala na ndị ọrịa dị elu site na ndị ọrịa dị ala.Na mgbakwunye, ụkpụrụ AUC nke ROC curve nke ụdị ihe ize ndụ nke prognostic bụ 0.905 maka amụma afọ 1, 0.942 maka amụma afọ 2, yana 0.966 maka amụma afọ 3.
Ndị nchọpụta kwuru na ndị ọrịa nwere CD8 + T cell infiltration dị elu na-enwe mmetụta na ọgwụgwọ ICI [33].Mmụba nke ọdịnaya nke mkpụrụ ndụ cytotoxic, mkpụrụ ndụ CD56 NK, mkpụrụ ndụ NK na sel CD8+ T na microenvironment na-alụso ọrịa ọgụ nwere ike ịbụ otu n'ime ihe kpatara mmetụta na-egbochi etuto ahụ [34].Nnyocha ndị gara aga gosiri na ọkwa dị elu nke tumor-infiltrating CD4 (+) T na CD8 (+) T na-ejikọta ya na ogologo ndụ dị ogologo [35].CD8 T cell infiltration na-adịghị mma, ibu neoantigen dị ala, yana microenvironment tumor nke na-egbochi ya nke ukwuu na-eduga na enweghị nzaghachi na ọgwụgwọ ICI [36].Anyị chọpụtara na akara ihe ize ndụ na-ejikọta ya na sel CD8 + T na mkpụrụ ndụ NK, na-egosi na ndị ọrịa nwere nnukwu ihe ize ndụ nwere ike ọ gaghị adị mma maka ọgwụgwọ ICI ma nwee ọganihu ka njọ.
CD161 bụ akara nke mkpụrụ ndụ egbu egbu (NK).CD8+CD161+ CAR-transduced cell T cell mediate kwalitere na vivo antitumor nrụpụta na HER2+ pancreatic ductal adenocarcinoma xenograft ụdị [37].Ndị na-egbochi ihe mgbochi mgbochi na-eche cytotoxic T lymphocyte metụtara protein 4 (CTLA-4) na protein ọnwụ cell 1 (PD-1)/programmed cell death ligand 1 (PD-L1) ụzọ ma nwee nnukwu ikike n'ọtụtụ ebe.Ngosipụta nke CTLA-4 na CD161 (KLRB1) dị ala na otu ndị nwere nsogbu dị elu, na-egosikwa na ndị ọrịa nwere ọnụ ọgụgụ dị elu nwere ike ọ gaghị eru eru maka ọgwụgwọ ICI.[38]
Iji chọta nhọrọ ọgwụgwọ kwesịrị ekwesị maka ndị ọrịa nwere nnukwu ihe ize ndụ, anyị nyochara ọgwụ mgbochi ọrịa cancer dị iche iche wee chọpụta na paclitaxel, sorafenib, na erlotinib, bụ ndị a na-ejikarị eme ihe na ndị ọrịa nwere PAAD, nwere ike dị mma maka ndị ọrịa nwere PAAD.[33].Zhang et al chọpụtara na ngbanwe n'ụzọ ọ bụla DNA mmebi mmeghachi omume (DDR) nwere ike iduga na-adịghị mma prognosis na prostate ọrịa cancer [39].Nnwale Pancreatic Cancer Olaparib Na-aga n'ihu (POLO) gosipụtara na ọgwụgwọ nlekọta na olaparib na-adị ogologo ndụ na-enweghị ọganihu ma e jiri ya tụnyere placebo mgbe chemotherapy dabeere na platinum nke mbụ na ndị ọrịa nwere pancreatic ductal adenocarcinoma na germline BRCA1/2 mutations [40].Nke a na-enye nchekwube dị ukwuu na nsonaazụ ọgwụgwọ ga-akawanye mma n'ime obere ndị ọrịa a.N'ime ọmụmụ ihe a, uru IC50 nke AZD.2281 (olaparib) dị elu n'ime ìgwè ndị nwere nsogbu dị elu, na-egosi na ndị ọrịa PAAD nọ n'òtù dị ize ndụ nwere ike iguzogide ọgwụgwọ na AZD.2281.
Ụdị amụma dị na ọmụmụ ihe a na-arụpụta ezigbo amụma amụma, mana ha dabere na amụma nyocha.Otu esi akwado nsonaazụ ndị a na data ụlọ ọgwụ bụ ajụjụ dị mkpa.Endoscopic fine needle aspiration ultrasonography (EUS-FNA) abụrụla ụzọ dị mkpa maka ịchọpụta ọnya pancreatic siri ike na nke extrapancreatic nwere mmetụta nke 85% na nkọwapụta nke 98% [41].Ọbịbịa nke EUS fine-needle biopsy (EUS-FNB) agịga na-adabere na uru aghọtara karịa FNA, dị ka nchọpụta nchọpụta dị elu, na-enweta ihe nlele na-echekwa ihe ndekọ akụkọ ihe mere eme, ma si otú a na-emepụta anụ ahụ na-alụso ọrịa ọgụ nke dị oké mkpa maka ụfọdụ nchoputa.ntụpọ pụrụ iche [42].Nyochaa nhazi nke akwụkwọ ndị ahụ gosipụtara na agịga FNB (karịsịa 22G) na-egosipụta arụmọrụ kachasị elu na iweta anụ ahụ sitere na oke pancreatic [43].N'ụlọ ọgwụ, ọ bụ naanị ọnụ ọgụgụ dị nta nke ndị ọrịa tozuru maka ịwa ahụ radical, na ọtụtụ ndị ọrịa nwere etuto anaghị arụ ọrụ n'oge nyocha mbụ.Na omume ụlọ ọgwụ, ọ bụ naanị ọnụ ọgụgụ dị nta nke ndị ọrịa kwesịrị ekwesị maka ịwa ahụ radical n'ihi na ọtụtụ ndị ọrịa nwere etuto na-adịghị arụ ọrụ n'oge nyocha mbụ.Mgbe nkwenye nke pathological site na EUS-FNB na ụzọ ndị ọzọ, a na-ahọrọ usoro ọgwụgwọ na-abụghị nke ịwa ahụ dị ka chemotherapy.Mmemme nyocha anyị na-esote bụ iji nwalee ihe atụ prognostic nke ọmụmụ a na ngalaba ịwa ahụ na nke na-abụghị nke ịwa ahụ site na nyocha nlegharị anya.
N'ozuzu, ọmụmụ ihe anyị hibere usoro ihe ize ndụ ọhụụ nke dabere na ejikọta ọnụ irlncRNA, nke gosipụtara uru prognostic na-ekwe nkwa na ndị ọrịa nwere ọrịa kansa pancreatic.Ụdị ihe ize ndụ nke prognostic anyị nwere ike inyere ndị ọrịa nwere PAAD aka dị iche iche maka ọgwụgwọ ahụike.
Ihe ndekọ data ejiri ma nyochaa na ọmụmụ ihe ugbu a dị n'aka onye edemede kwekọrọ na arịrịọ ezi uche dị na ya.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Ọrụ mgbasa ozi nke nrụpụta onwe onye na nhazi mmetụta uche nke mmetụta uche na-adịghị mma n'oge ọrịa COVID-19: ọmụmụ ihe na-agafe.Int J Ment Health Nurs [akwụkwọ akụkọ].2021 06/01/2021; 30 (3): 759–71 .
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, et al.Echiche ndị ezinaụlọ na-eme mkpebi ọzọ na ngalaba nlekọta ahụike: nyocha usoro.INT J NURS STUD [akwụkwọ akụkọ;nyochaa].2023 01/01/2023; 137:104391 .
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Ọrịa kansa Pancreatic.Lancet.[Akwụkwọ akụkọ;nkwado nyocha, NIH, extramural;nkwado nyocha, gọọmentị na-abụghị US;nyochaa].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemiology nke ọrịa cancer pancreatic.Akwụkwọ akụkọ ụwa nke Gastroenterology.[Akwụkwọ akụkọ, nyochaa].2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. nomogram ọhụrụ metụtara tp53 maka ịkọ amụma nlanarị na ndị ọrịa nwere ọrịa kansa pancreatic.BMC Cancer [akwụkwọ akụkọ].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Mmetụta nke ọgwụgwọ lekwasịrị anya ngwọta na ike ọgwụgwụ metụtara ọrịa cancer na-arịa ọrịa cancer colorectal na-anata chemotherapy: nnwale a na-achịkwaghị achịkwa.Nọọsụ ọrịa kansa.[Akwụkwọ akụkọ;ule a na-achịkwa na-enweghị usoro;gọọmentị na-abụghị United States kwadoro ọmụmụ ihe ahụ].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, et al.Ọkwa carcinoembryonic antigen (CEA) nke arụchara arụ ọrụ na-ebu amụma ihe ga-esi na ya pụta mgbe a gbasasịrị ọrịa cancer colorectal na ndị ọrịa nwere ọkwa CEA tupu ịwa ahụ.Center for Translational Cancer Research.[Akwụkwọ akụkọ].2020 01.01.2020; 9 (1): 111–8 .
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, et al.lncRNA ndị metụtara ọrịa na-emepụta mbinye aka ọhụrụ ma buo amụma mgbochi mgbochi nke carcinoma hepatocellular mmadụ.Mol Ther Nucleic acids [Akwụkwọ akụkọ].2020 2020-12-04;22:937 - 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunotherapy maka ọrịa cancer pancreatic: ihe mgbochi na ọganihu.Ann Gastrointestinal Dọkịta [Akwụkwọ akụkọ akụkọ;nyochaa].2018 07/01/2018; 2 (4): 274–81 .
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Ogologo RNA ndị na-abụghị koodu (LncRNAs), viral tumor genomics na aberrant splicing omume: ọgwụgwọ ọgwụgwọ.AM J CANCER RES [akwụkwọ akụkọ;nyochaa].2021 01/20/2021;11 (3): 866–83 .
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Nchọpụta akara akara lncRNA jikọtara ya na prognosis nke ọrịa cancer endometrial.Mmezu nke sayensị [magazine edemede].2021 2021-01-01; 104 (1): 311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, et al.Nyocha zuru oke nke RNA na-ejikọta protein prognostic genes na ndị na-achọ ọgwụ na papillary cell renal cell carcinoma.pregen.[Akwụkwọ akụkọ].2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, et al.Njirimara nke autophagy metụtara ogologo RNA na-abụghị koodu na-ebu amụma amụma gbasara ọrịa ara ara.pregen.[Akwụkwọ akụkọ].2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Immune metụtara isii lncRNA mbinye aka na-eme ka prognosis dị na glioblastoma multiforme.MOL Neurobiology.[Akwụkwọ akụkọ].2018 01.05.2018;55 (5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, et al.mbinye aka tri-lncRNA ọhụrụ na-ebu amụma ịlanarị ndị ọrịa nwere ọrịa kansa pancreatic.Ndị nnọchi anya ONKOL.[Akwụkwọ akụkọ].2018 12/01/2018; 40 (6): 3427–37 .
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 na-akwalite ọganihu ọrịa kansa pancreatic site na ịhazi okwu LIN28B na ụzọ PI3K/AKT site na sponge miR-577.Mol Therapeutics - Nucleic acid.2021; 26:523–35 .
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, et al.Nzaghachi dị mma n'etiti lncRNA FLVCR1-AS1 na KLF10 nwere ike igbochi ọganihu ọrịa kansa pancreatic site na ụzọ PTEN/AKT.J EXP Clin Cancer Res.2021; 40 (1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Nchọpụta nke mkpụrụ ndụ ihe nketa iri na atọ na-ebu amụma nlanarị n'ozuzu ya na carcinoma hepatocellular.Biosci Rep [akwụkwọ akụkọ].2021 04/09/2021.


Oge nzipu: Sep-22-2023